1、洋葱留种方法有杂交制种和常规留种二种。目前，我们一般采用常规留种这一方法。洋葱留种的时间较长，要经两年多时间才能收获种子，第一年秋育苗，第二年秋栽葱头种，第三年夏收获种子。开花期又值梅雨季节，往往造成授粉不良，结实率不高。因此，在栽培留种技术必须注意抓好五个技术环节：2、严格选好葱头种（鳞茎）。挑选株型纯正，假茎较高，粗细适中，叶片浓绿，长势旺盛，葱头膨大较快，球茎较粗大，种球表皮光滑，具有本品种特征和无病虫害的葱头（鳞茎）作为留种用的葱种。裂葱球、假茎粗、颈部和四周向下凹陷的葱头，易腐烂，不宜留作种球用。当洋葱下部第1-2片叶黄、假茎变软，地上部分开始倒伏，鳞茎外层鳞片变干时，选择晴天，连根拔起种株，实行单收、单凉干、单挂藏。
3、选择好育种地。留种地宜选地势较高的砂壤土，土地平整，土质肥沃，排灌方便。同时，洋葱属异花授粉植物，为昆虫和风媒传粉，要注意品种间的隔离，且不能与洋葱生产大田毗邻，以免传粉变异和传播病虫害。下种前，要深翻土层，多施农家肥和磷钾肥。
4、适时定植葱头种。鳞茎定植有秋栽和春栽两种。春栽在“芒种”至“小暑”，秋栽以“秋分”前后为好。株行距16厘米×23厘米左右。同时，栽葱头时要稍深一些。
5、精细管理。一是定植后，浇足保苗水、越冬水、返青水，保持土壤湿润即可。并施好返青、花茎、花球三次肥。二是中耕作草，松土保墒，保苗促长，严防病虫草害。三是搭架整枝与人工授粉。洋葱根系较浅，种株生长不稳固，易被风吹倒，影响授粉。因此，必须在抽苔后、开花前及时搭架防止倒伏。开花后还要整枝，分批剔除生长瘦弱的花苔，每株只留5—6个，便于集中养分，利于种子充实饱满。同时，洋葱的花粉耐湿性很差，开花盛期又正值雨季。所以，要进行人工辅助授粉，可提高结实率，增加种子产量。
6、及时采藏种子。秋栽在“大暑”前后采种，春栽洋葱在“处暑”前后采种。当花球顶部少数蒴果变黄开裂露出黑色种子时，分期分批在露水干后，距花苔33厘米处将花球剪下，然后把每7—10个花球绑成一束，倒挂在屋檐下（防止曝晒）后熟。阴干几天，搓下种子，再适当晒干后用隔湿材料包装贮藏，防止种子混杂、烟熏、虫蛀和受潮而霉坏。留种量大，无法挂凉干时，花球凉晒一定要防止堆积太厚（不宜超过20厘米），使其逐渐阴凉干燥，切忌烘干。