1、普通库贮藏：果实入库初期，库内温度高，湿度大，应整天打开门窗通风换气，降温降湿，气温低的天气，白天开窗增温，晚上关窗保温。为减少果实水分蒸发，贮藏中后期，果箱内盖一层塑料薄膜，当果皮上或薄膜上出现水珠时揭膜干后再盖。果实入库后要每隔10~15天检查一次，挑出伤果、烂果、病果。立春后，5~10天选果一次。
2、塑料薄膜帐篷贮藏：主要就是经常查看，当帐壁上凝集水珠时应打开帐篷通风透气，避免脐橙变质和腐烂。每10~15天检查选果一次，挑出伤果、烂果、病果。
3、地窑贮藏：果实入窖后，每隔7~10天检查一次，主要检查烂果情况和换入新鲜空气，及时降温降湿。初期还要提水汽。检查烂果时人员入窖前要先向窖内鼓风，驱除二氧化碳，然后入窖。提水汽是用一把稻草吊在窖内，待稻草吸足水汽变湿后再换一把干稻草。这种地窖贮藏脐橙6个月，好果率可达90%左右。